Penyelenggaraan pendidikan formal di Pondok Pesantren Daar El-Qolam adalah Madrasatul Mu’allimin Al-lslamiyah (MMI), yang telah dimulai sejak tahun 1968 dengan masa studi 6 tahun bagi tamatan SD/MI, dan 3 tahun bagi tamatan SLTP/MTs.

Pendidikan formal tersebut di atas sebagai implementasi dari misi lembaga Pondok Pesantren yang mempersiapkan individu-individu yang unggul dan berkualitas menuju terbentuknya khayra ummah (generasi terbaik) yang dikeluarkan untuk manusia. Di samping itu, sebagai misi khusus adalah mempersiapkan kader-kader ulama dan pemimpin ummat yang mutafaqqih fi-d-dîn; baik sebagai ilmuwan/akademisi maupun sebagai praktisi dan mampu untuk melaksanakan dakwah Islamiyah.

Dilihat dari jenjang dan masa studinya, MMI Daar el-Qolam memang setingkat dengan MA dan SMA pada umumnya, namun dipandang dari hakekatnya, terdapat beberapa perbedaan mendasar, antara lain:

1. Selain nilai-nilai keislaman dan keindonesiaan, MMI juga berlandaskan dan mengacu pada nilai-nilai kepondokpesantrenan dan kejuangan (mujâhadah).

2. Kata “mu`allimîn” pada MMI tidak sekadar bermakna pada guru sebagai sebuah profesi, tetapi lebih ditekankan pada aspek jiwa, akhlak dan wawasan guru yang harus dimiliki oleh para santri atau alumninya. Itu sebabnya fungsi guru di MMI tak terbatas pada transfer of knowledge namun lebih pada upaya transfer of value and morality.

Dengan demikian, tujuan pendidikan di MMI Daar El-Qolam mengacu pada Tujuan Pendidikan Nasional yang berlaku, khususnya pada jenjang pendidikan (menengah pertama dan menengah atas) dengan penekanan khusus pada upaya mempersiapkan santri/alumni yang:

1. Menguasai bekal-bekal dasar keulama’an/kecendekiaan, kepemimpinan dan keguruan.

2. Mau dan mampu mengembangkan bekal-bekal dasar tersebut secara mandiri/long life education.

3. Siap mengamalkannya di tengah-tengah masyarakat dengan ikhlas, cerdas, dan beramal.

Arah dan Tujuan Pendidikan Pondok Pesantren Daar el-Qolam

1. Tujuan Kemasyarakatan

Dalam tujuan ini, segala yang akan dijumpai dan dialami kelak di masyarakat, itulah yang akan diajarkan kepada santri. Segala tindakan dan pelajaran, bahkan segala gerak-gerik yang ada di Pondok Pesantren Daar el-Qolam akan ditemui dalam perjuangan hidup bermasyarakat.

Pesantren umpama miniatur masyarakat atau dunia kecil. Gambaran nyata kehidupan tempat santri belajar hidup sebelum hidup pada dunia yang sebenarnya. Pesantren membekali mereka dengan berbagai macam ilmu, baik ilmu teoritis maupun ilmu praktis dengan memberi tanggung jawab untuk terus berinovasi mencari dan menciptakan. Seperti menanamkan mental bekerja dalam diri santri sendiri; mulai dari elajar membersihkan kamar, menjadi imam salat, mengurus dan memimpin santri yang lain, hingga menjadi pelaksana sebuah kegiatan (event organizer).

Dalam upaya ini diharapkan apabila mereka nanti terjun dalam masyarakat, di mana pun dirinya berada, dan apapun bentuk masyarakatnya, akan tumbuh rasa percaya diri dan dapat dengan mudah beradaptasi. Begitu pula dalam menekuini berbagai profesi yang ada.

2. Tujuan Ibadah dalam Mencari Ilmu

Terkait dalam hal ini, Pondok Pesantren Daar el-Qolam menanamkan dalam diri santrinya keyakinan untuk menuntut ilmu dengan niat yang suci, yaitu ibadah memenuhi perintah Allah SWT, untuk menjadi generasi yang beriman, bertakwa, dan haus ilmu (mu’min, muttaqin, dan rasikhina fi-l-`ilmi).

Upaya pesantren dalam menciptakan cendekiawan-cendekiawan yang berjiwa santri, tidak hanya berhenti pada semangat, tidak adanya dikotomi ilmu. Lebih dari itu, pada aplikasinya, Pondok Pesantren Daar el-Qolam mengadopsi sistem pelajaran sekolah ke dalam kurikulumnya, dan mewujudkannya dalam tindakan serius membina mata pelajaran tersebut dengan tetap menjaga pengetahuan agama dan pengetahuan bahasa yang menjadi sebuah ciri khas dari Pondok Pesantren Modern.

Diawali upaya ini pesantren diharapkan dapat menjadi basis dasar dalam menciptakan teknologi dalam pelbagai bidang seperti pertanian, teknologi informasi, kimia analisis, fisika dan sebagainya. Sehingga setiap santri nantinya memiliki pelbagai peluang dan kesempatan, serta sarana dasar untuk mengembangkan bakat dan minatnya.

Daar el-Qolam 1, Daar el-Qolam 2, dan Daar el-Qolam 3

Dalam perkembangannya selama 44 tahun, Program Pendidikan Daar el-Qolam terbagi ke dalam tiga lokasi dan karakteristik, yakni Daar el-Qolam 1, Daar el-Qolam 2 (Program Excellent Class), dan Daar el-Qolam 3 (Program Ekstensi).

Daar el-Qolam 1 adalah program pembinaan yang dikhususkan untuk santri tamatan SD/MI dengan masa belajar 6 tahun. Sedangkan Daar el-Qolam 2 adalah program unggulan di mana santri-santri yang berasal dari Daar el-Qolam 1 yang memiliki keunggulan moral, akademik dan kedisiplinan yang berasal dari Daar el-Qolam 1. Daar el-Qolam 2 juga memberikan peluang bagi santri yang baru mendaftar untuk masuk di program ini setelah melewati beberapa tahapan seleksi tambahan yang ditentukan.

Adapun Daar el-Qolam 3 dikhususkan untuk tamatan SMP/MTs dengan masa belajar 3 tahun. Dengan masa belajar yang lebih singkat dari Daar el-Qolam 1 dan 2, program ini lebih ditekankan kepada program SMA dengan semangat pesantren, dengan perpaduan kurikulum pesantren dan umum.